北京大学的政治学研究具有悠久的历史。北京大学的前身京师大学堂就设有政治科政治学目。新中国成立后，我国的政治学研究经历了曲折的发展历程。
- 1982年，北京大学在全国较早地重新设立了政治学专业；
- 1988年，北京大学恢复建立了政治学与行政管理系；
- 1998年7月，成立政治发展与政府管理研究中心；
- 1999年7月，为发挥理论优势，深入研究政治发展和政府管理的重大理论和实践问题，成立了北京大学政治发展与政府管理研究所；
- 2000年12月26日，本所被批准为教育部人文社会科学百所重点研究基地——政治学重点研究基地；
- 2013年12月，基地经教育部批准，作为国家治理协同创新中心的牵头单位，与四校一院（北京大学、复旦大学、吉林大学、中山大学、中国财政科学研究院）同步运行；
- 2016年，更名为“北京大学国家治理研究院”。
